在1999年，一艘外星宇宙戰(zhàn)艦墜落到了地球，人們用了了十年的時(shí)間修復(fù)并取名為MACROSS。2009年，MACROSS要塞正在舉辦一場(chǎng)偶像歌星林明美（飯島真理 配音）的演唱會(huì)，突然空襲警報(bào)響起，要塞開始了變形。戰(zhàn)斗中，一條輝（長(zhǎng)谷有洋 配音）駕駛著變形戰(zhàn)斗救下一名少女，戰(zhàn)機(jī)卻由于速度過快撞進(jìn)外層艙室。安定后，輝發(fā)現(xiàn)救得是林明美。倆人相識(shí)后，為使明美高興，輝偷開教練機(jī)帶著明美去兜風(fēng)。敵人趁機(jī)出現(xiàn)，好在朋友這時(shí)挺身相救，經(jīng)過一場(chǎng)混戰(zhàn)，輝和早瀨未沙（土井美加 配音）醒過來，發(fā)現(xiàn)在一個(gè)荒蕪的星球上。他們了解到，五十萬(wàn)年前，一個(gè)叫普羅多的古代文明發(fā)展到頂盛時(shí)，已經(jīng)可以借遺傳密碼無性繁殖后代，于是國(guó)家分裂為由男性組成的杰特拉帝和由女性組成的赫而特蘭帝開始了長(zhǎng)達(dá)數(shù)萬(wàn)年的戰(zhàn)爭(zhēng)。在戰(zhàn)爭(zhēng)中文明急劇衰退了，曾經(jīng)偉大的文化被遺忘殆盡，退化成了只會(huì)戰(zhàn)斗的種族，為了維護(hù)和平，他們將會(huì)采取怎樣的行動(dòng)……　　《超時(shí)空要塞》是1982至83年間播出的一部電視動(dòng)畫，本片在其基礎(chǔ)上精簡(jiǎn)改編而成。